Através da execução do Prolagos, o CENTRAB desenvolveu capacitação nas áreas da física, da geologia, da química, da biologia e da sócio-economia.

Foram desenvolvidos modelos numéricos de circulação costeira e de águas interiores para avaliar e prever trocas nas condições físicas da Lagoa de Araruama, isto é, salinidade, circulação, dispersão, marés, etc. Estes modelos auxiliaram, entre outras coisas, a avaliar as consequências do aporte de esgotos orgânicos e industriais nos ecossistemas, e o impacto dos assoreamentos nos processos biogeoquímicos e na navegação.

O estado trófico da Lagoa, o potencial de eutrofização, e o papel do sedimento na ciclagem da matéria na Lagoa de Araruama também foram objeto de estudo pelo CENTRAB.

Na área biológica foram feitos estudos sobre a distribuição, crescimento e reprodução das principais espécies de algas, invertebrados e peixes, e analizado o potencial do uso de determinadas espécies para aquacultura.

Na parte sócio-econômica, além do projeto denominado Rede Lagoa Viva que visou educar os jovens sobre as condições ambientais da Lagoa, foram desenvolvidos estudos sobre a pesca, as condições sócio-econômicas das populações do entorno da Lagoa, o turismo, e usos industriais e agrícolas dos municípios da Região dos Lagos. Foram realizadas ainda avaliações das necessidades e dos programas de saneamento.